「菲海奇航：臺灣與菲律賓的跨文化對話」展覽於該館藝文中心1樓展覽室展出，精選館藏與臺灣和菲律賓兩地歷史文化交流相關的古籍、名家手稿、明信片等珍貴館藏及相關出版品，內容豐富且多元。
展覽規劃四大主題單元，包含「以物易物．古籍記載」、「季風引航．貿易往來」、「南島共鳴．文化交織」以及「文藝脈動．當代對話」。內容從早期海上貿易、季風航行到南島文化交流，再延伸至近現代文學藝術對話，透過珍貴館藏呈現臺菲兩地長久而深厚的歷史連結。
展覽提供中英雙語展示說明、語音導覽、精彩影片及閱讀角專區，並為免費參觀。